常用生物信息学数据库包括哪些

网站编辑2023-05-17 08:17:08524

生物信息学数据库是生物信息学研究中不可或缺的资源,以下是一些常用的生物信息学数据库:

1. GenBank:由美国国家生物技术信息中心(NCBI)维护的DNA序列数据库,包含了来自全球各地的数百万条DNA序列。

2. UniProt:由欧洲生物信息研究所(EBI)、瑞士生物信息研究所(SIB)和美国国家生物技术信息中心(NCBI)共同维护的蛋白质序列数据库,包含了来自全球各地的数百万条蛋白质序列。

3. NCBI:美国国家生物技术信息中心维护的多种生物信息学数据库,包括GenBank、PubMed、BLAST等。

4. Ensembl:由欧洲生物信息研究所(EBI)和威尔士基因组中心(WGC)共同维护的基因组注释数据库,包含了多种物种的基因组序列、注释信息和基因表达数据等。

5. KEGG:由京都大学生物信息学中心维护的代谢通路数据库,包含了多种物种的代谢通路信息、基因组注释信息和基因表达数据等。

6. PDB:由世界各地的科学家共同维护的蛋白质结构数据库,包含了数万个蛋白质的三维结构信息。

7. STRING:由欧洲分子生物学实验室(EMBL)维护的蛋白质互作网络数据库,包含了多种物种的蛋白质互作信息和功能注释信息等。

以上是一些常用的生物信息学数据库,它们提供了丰富的生物信息学数据和工具,为生物信息学研究提供了重要的支持。

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